Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PPFIBP2Q8ND30 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIBP2Q8ND30 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIBP2Q8ND30 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PPFIBP2Q8ND30 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP2Q8ND30 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP2Q8ND30 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP2Q8ND30 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP2Q8ND30 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP2Q8ND30 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP2Q8ND30 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP2Q8ND30 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PPFIBP2Q8ND30 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms