Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BBOF1Q8ND07 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BBOF1Q8ND07 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms