Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
COLGALT1Q8NBJ5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COLGALT1Q8NBJ5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms