Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRPF38AQ8NAV1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRPF38AQ8NAV1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms