Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LINC00612Q8N6U2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
LINC00612Q8N6U2 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms