Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
SMIM20Q8N5G0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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