Protein–RNA interactions for Protein: Q8N567

ZCCHC9, Zinc finger CCHC domain-containing protein 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC9Q8N567 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZCCHC9Q8N567 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ZCCHC9Q8N567 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms