Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SCML4Q8N228 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCML4Q8N228 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms