Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
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CA13Q8N1Q1 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CA13Q8N1Q1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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CA13Q8N1Q1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CA13Q8N1Q1 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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CA13Q8N1Q1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
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CA13Q8N1Q1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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CA13Q8N1Q1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
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CA13Q8N1Q1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CA13Q8N1Q1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
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