Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Y2

ZNF444, Zinc finger protein 444, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444Q8N0Y2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF444Q8N0Y2 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZNF444Q8N0Y2 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms