Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYT3

CCDC170, Coiled-coil domain-containing protein 170, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC170Q8IYT3 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC170Q8IYT3 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC170Q8IYT3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms