Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW6

ARID3B, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3BQ8IVW6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARID3BQ8IVW6 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARID3BQ8IVW6 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms