Protein–RNA interactions for Protein: Q86UC2

RSPH3, Radial spoke head protein 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH3Q86UC2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
RSPH3Q86UC2 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RSPH3Q86UC2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms