Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RBBP6Q7Z6E9 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RBBP6Q7Z6E9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms