Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Y7

KRT28, Keratin, type I cytoskeletal 28, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT28Q7Z3Y7 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KRT28Q7Z3Y7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
KRT28Q7Z3Y7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
KRT28Q7Z3Y7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms