Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1W4

LRRC8D, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8D, humanhuman

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8DQ7L1W4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
LRRC8DQ7L1W4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
LRRC8DQ7L1W4 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms