Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0J3

SV2A, Synaptic vesicle glycoprotein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SV2AQ7L0J3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SV2AQ7L0J3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SV2AQ7L0J3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms