Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
USP50Q70EL3 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
USP50Q70EL3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
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