Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV77

C9orf139, Uncharacterized protein C9orf139, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf139Q6ZV77 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
C9orf139Q6ZV77 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms