Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZTR5

CFAP47, Cilia- and flagella-associated protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP47Q6ZTR5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CFAP47Q6ZTR5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CFAP47Q6ZTR5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms