Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FAM43BQ6ZT52 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
FAM43BQ6ZT52 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.8 ms