Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT12

UBR3, E3 ubiquitin-protein ligase UBR3, humanhuman

Predictions only

Length 1,888 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR3Q6ZT12 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
UBR3Q6ZT12 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
UBR3Q6ZT12 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms