Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN5

FOXI2, Forkhead box protein I2, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXI2Q6ZQN5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXI2Q6ZQN5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXI2Q6ZQN5 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms