Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM72Q6ZMU5 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIM72Q6ZMU5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms