Protein–RNA interactions for Protein: Q6XYB7

LBX2, Transcription factor LBX2, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX2Q6XYB7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LBX2Q6XYB7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LBX2Q6XYB7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LBX2Q6XYB7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms