Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SMARCD3Q6STE5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMARCD3Q6STE5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms