Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
DUX4L9Q6RFH8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms