Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TUBA3EQ6PEY2 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBA3EQ6PEY2 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms