Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC27A1Q6PCB7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC27A1Q6PCB7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms