Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GDF6Q6KF10 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GDF6Q6KF10 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.2 ms