Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPR1

ETFRF1, Electron transfer flavoprotein regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFRF1Q6IPR1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
ETFRF1Q6IPR1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
ETFRF1Q6IPR1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms