Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
INTS3Q68E01 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
INTS3Q68E01 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms