Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ALS2CLQ60I27 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ALS2CLQ60I27 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms