Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI4

RNF123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, humanhuman

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF123Q5XPI4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
RNF123Q5XPI4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC28■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.07
RNF123Q5XPI4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
RNF123Q5XPI4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms