Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 AC022762.2-201ENST00000600308 1353 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
CHIC1Q5VXU3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
CHIC1Q5VXU3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
CHIC1Q5VXU3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms