Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAMD13Q5VXD3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAMD13Q5VXD3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms