Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GARNL3Q5VVW2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GARNL3Q5VVW2 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.5 ms