Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVM6

CCDC30, Coiled-coil domain-containing protein 30, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC30Q5VVM6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CCDC30Q5VVM6 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC30Q5VVM6 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms