Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRPF38BQ5VTL8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRPF38BQ5VTL8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms