Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HDGFL1Q5TGJ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms