Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TMEM78Q5T7P6 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TMEM78Q5T7P6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms