Protein–RNA interactions for Protein: Q5T5S1

CCDC183, Coiled-coil domain-containing protein 183, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC183Q5T5S1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC183Q5T5S1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC183Q5T5S1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms