Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LDLRAP1Q5SW96 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LDLRAP1Q5SW96 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LDLRAP1Q5SW96 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LDLRAP1Q5SW96 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
LDLRAP1Q5SW96 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LDLRAP1Q5SW96 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
LDLRAP1Q5SW96 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LDLRAP1Q5SW96 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LDLRAP1Q5SW96 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LDLRAP1Q5SW96 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
LDLRAP1Q5SW96 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
LDLRAP1Q5SW96 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms