Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSJ5

HP1BP3, Heterochromatin protein 1-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HP1BP3Q5SSJ5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
HP1BP3Q5SSJ5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
HP1BP3Q5SSJ5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms