Protein–RNA interactions for Protein: Q5GLZ8

HERC4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,057 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4Q5GLZ8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HERC4Q5GLZ8 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HERC4Q5GLZ8 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms