Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH76

XKR4, XK-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 650 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XKR4Q5GH76 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
XKR4Q5GH76 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
XKR4Q5GH76 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms