Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KLHL22Q53GT1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KLHL22Q53GT1 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms