Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATP13A4Q4VNC1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP13A4Q4VNC1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP13A4Q4VNC1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms