Protein–RNA interactions for Protein: Q4JDL3

PTPN20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN20Q4JDL3 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPN20Q4JDL3 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPN20Q4JDL3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms