Protein–RNA interactions for Protein: Q494R4

CCDC153, Coiled-coil domain-containing protein 153, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC153Q494R4 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CCDC153Q494R4 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CCDC153Q494R4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms